生物肥料的生产技术不仅仅是简单的发酵过程，它涉及几个关键环节：

　　1、严格对生产菌种的引进和选择引进菌种首先应明确菌种特点和功能，明确特定微生物肥料的生物学特性、适应当地突然气候环境、特有的功能以及显效作用程度等，一切条件具备后方可选用。

　　2、具有相关生产工艺及设备微生物肥料整个生产工艺的好坏对终的产品质量起至关重要的作用。其生产一般是从纯菌开始，进过逐级培养发酵再经成品合成加工制成各种机型微生物肥料。全生产过程必须在完全封闭、严格无菌状态下进行，严格控制培养发酵过程各项环境条件，如温度、酸碱度(pH)等诸多因素。生产设备有菌剂培养发酵成套设备和生产合成各种剂型微生物肥料成品的生产线设备，这是产品的基本保障。如避免直接日晒，放置在恒定低温、干燥处贮存，切记反复冻融。

　　3、建立微生物肥料质量检测体系

　　为保证产品质量，需要严格质量标准规范和完备的检测手段，检测出厂的每一批产品和定期监测的贮存产品，生产部门要有技术人员 。