以药渣为主要原料生产有机肥料，需使用发酵菌种并配合相关原料发酵腐熟处理后，才能获得合格的有机肥料。发酵腐熟过程主要是通过菌种的好氧微生物的高温发酵作用，对物料进行无害化、稳定化和除臭等处理。

  无论采用什么配比，中药渣、畜禽粪便或者其他原料搅拌均匀后的物料含水量必须在50-60%之间，确保松散透气性好。

  由于中药渣的整个发酵腐熟过程是好氧发酵过程，因此，发酵过程中氧气越充足效果越好。因此堆积好的物料，通过对发酵温度的监测进行翻堆，其作用：一是透气，向料堆内供氧，促进物料的发酵腐熟；二是搅拌均匀，使表层物料能翻倒内部；三是通过高温使原料中的病害微生物、病虫卵、杂草种子等也被彻底杀死。